Japán erdői kilenc ökorégiót alkotnak, amelyek tükrözik a szigetek éghajlatát és domborzatát. Délről észak felé utazva Rjúkjú- és Bonin-szigetek nedves trópusi és szubtrópusi erdeivel találkozunk először. A fő szigetek mérsékelt éghajlatú területein mérsékelt égövi lombhullató- és vegyes erdőket láthatunk, a hideg északi régióban pedig fenyveseket.
Az ötvenes és hatvanas évek gyors iparosítása közben elhanyagolták a környezet védelmét. Azóta viszont nagy erőfeszítéseket tesznek az élhető környezet fenntartásáért. Sikereket is értek el. Jelenleg legfontosabbnak a következőket tartják: a városi légszennyezés csökkentése, a szennyvíz-kezelés, a vizek túlságos feldúsulása tápanyagokkal („algásodás”), a vegyszerek kezelése.
Japán élenjáró ország az új, környezetbarát technológiák fejlesztésében. Ezeknek mára a gazdasági jelentősége is nagy, exportálható árut jelentenek.
Nemzeti parkok:
Hokkaido
Rishiri-Rebun-Sarobetsu Nemzeti Park
Shiretoko Nemzeti Park
Daisetsuzan Nemzeti Park
Akan Nemzeti Park
Kushiro Shitsugen Nemzeti Park
Shikotsu-Toya Nemzeti Park
Tohoku
Towada-Hachimantai Nemzeti Park
Rikuchu Kaigan Nemzeti Park
Bandai-Asahi Nemzeti Park
Kantō
Nikkō Nemzeti Park
Oze Nemzeti Park
Chichibu Tamakai Nemzeti Park
Joshinetsu Kogen Nemzeti Park
Ogasawara Nemzeti Park
Fuji-Hakone-Izu Nemzeti Park
Chūbu
Chūbu-Sangaku Nemzeti Park
Hakusan Nemzeti Park
Minami Alps Nemzeti Park
Kansai
Ise-Shima Nemzeti Park
Yoshino-Kumano Nemzeti Park
Chūgoku & Shikoku
San-in Coast Nemzeti Park
Daisen-Oki Nemzeti Park
Setonaikai Nemzeti Park
Ashizuri-Uwakai Nemzeti Park
Kyūshū
Saikai Nemzeti Park
Unzen-Amakusa Nemzeti Park
Aso Nemzeti Park
Kirishima-Yaku Nemzeti Park
Okinawa
Iriomote Nemzeti Park
